主要研究 今天

由于增加了两种新仪器，a PacBio Sequel系统 和一个 纳米孔GridION，联合国 哈伯德基因组研究中心 (HCGS)及其合作伙伴 协同核心湿实验室, 现在可以对更长的DNA片段进行排序了吗, 哪一种方法更准确，应用范围更广——尤其是在处理植物和微生物时. 直到最近, HCGS的服务是基于基因组的短读测序——在所有生物体中发现的遗传指令——这需要在测序之前将遗传物质分解成小片段或块. 这些新的长读测序服务将于2024年初向永利app新版本官网地址的内部和外部组织提供.

利用新技术加强基因组研究

短读测序和长读测序都是DNA和RNA测序的一种. 然而, 短读测序通常成本更低, 快, 更广泛使用，可以捕获基因组结构中的大多数遗传变异, 长读测序允许检测基因组之间复杂的结构差异.

“短读测序, 我们可以做很多事情，支持很多项目,W解释道。. 凯利·托马斯，HCGS的主任和教授 分子，细胞和生物医学科学 在中. “而不是对数百个核苷酸进行序列排序, 较长的阅读序列将由数千个核苷酸组成, 有时成千上万, 这样我们就能更好地识别出那些需要更长的基因链的变异.”

在农业和病原体研究中的应用与启示

例如, 长读测序将允许更精确地组装大型基因组，如农业植物的基因组, 促进识别农业作物品种之间有意义的遗传差异，并将特定基因与农民和/或消费者感兴趣的性状联系起来.

“长读测序对于提供有关新出现病原体的完整信息非常重要...你可以从片段上看，但要获得全貌，长读序列是有帮助的.” ~ W. 凯利•托马斯他是分子、细胞和生物医学科学教授

根据 汤姆•戴维斯, 植物生物学和遗传学名誉教授, 他和他在主要研究的研究团队在草莓和藜麦遗传学方面的工作依赖于校外组织的长读测序.

“我们对将这些新的DNA测序技术添加到主要研究 HCGS曲目中感到非常兴奋,戴维斯补充道。. “有内部, HCGS的长读测序服务将使我们能够更快、更经济地获取由尖端PacBio和Nanopore技术产生的大量信息数据集.”

长读测序还将允许在研究微生物方面有更大的应用, 像细菌, 病原微生物.

“长读测序对于提供有关新出现病原体的完整信息非常重要,W补充道。. 凯利•托马斯. “即使是导致COVID的SARS-CoV-2病毒也有数万个核苷酸长. 你可以从片段上看，但要获得全貌，长读序列是有帮助的.”

根据 伊阿古黑尔, 联合国大学可持续农业和粮食系统副教授, 通过HCGS提供的长读测序服务将支持他对被忽视和研究不足的作物的研究.

“通常缺乏这些作物类型的基因组资源, 这些信息对于实施现代育种方法是必要的,黑尔解释道. “有了这些新仪器, 现在，在内部开发这样的基因组资源是可以实现的, 让我们在一个赛季内从0到60.”

HCGS的两个新的长读测序仪和其他仪器的添加是通过一个 联邦拨款得到参议员奥巴马的支持. Jeanne Shaheen在2022年. 1美元.900万美元的专项拨款支持在联合国大学购买新设备，以提高该大学的测试能力, 对致病性威胁进行监测和排序. 托马斯补充说，这些致病性威胁不仅仅是人类病原体.

“我们还需要考虑和监测食物病原体和对我们粮食安全的威胁,托马斯说. “无论是人类健康, 植物卫生, 动物健康或环境健康, 基因组学在其中扮演着重要的角色.”

想了解更多永利app新版本官网地址这些和其他服务，从HCGS提供? 参观 哈伯德中心的服务网页 或电子邮件 主要研究.hcgs@主要研究.edu 了解更多信息. 当长读测序服务信息可用时，服务网页将更新.